Logiciels bioinformatiques développés à l'UQAM
Dans le cadre de ses activités de recherche, le corps enseignant développe des logiciels de bioinformatique. Les étudiants du DESS en bioinformatique sont souvent invités à améliorer des outils informatisés existants et aussi à en développer de nouveaux qui tiennent compte des avancées les plus récentes de la bioinformatique.
Les plus fiers représentants de tels outils bioinformatiques à l'UQAM sont:
- T-Rex: plateforme web pour l'analyse phylogénétique (versions Mac et Windows)
- HTS Corrector
- OVW: Optimal Variable Weighting
- Linear and Polynomial RDA and CCA
- Robinson and Foulds topological distance
- Armadillo: plateforme de flux de travaux pour l'analyse phylogénétique et bioinformatique
- MiRdup: prediction et validation des microARN
- WMP: Wheat MicroRNA Portal
- PGR: Protein Graph Repository